Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms