Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQ90 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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