Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3bpQ9CQ82 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms