Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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