Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms