Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms