Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms