Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms