Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms