Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms