Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms