Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms