Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc26a5Q99NH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms