Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms