Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms