Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms