Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac9Q99N13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms