Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms