Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt84Q99M73 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt84Q99M73 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms