Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms