Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RtcbQ99LF4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms