Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms