Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms