Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99KU6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99KU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99KU6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99KU6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms