Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms