Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms