Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpifQ99KR7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PpifQ99KR7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms