Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lactb2Q99KR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms