Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms