Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp2Q99K23 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms