Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms