Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TrabdQ99JY4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TrabdQ99JY4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TrabdQ99JY4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TrabdQ99JY4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms