Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms