Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms