Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms