Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spdl1Q923A2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spdl1Q923A2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms