Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn1Q922Y1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms