Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip1Q922J3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms