Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms