Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm2Q91YD4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm2Q91YD4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms