Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp6Q91WS2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp6Q91WS2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms