Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms