Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms