Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms