Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms