Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul7Q8VE73 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul7Q8VE73 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cul7Q8VE73 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cul7Q8VE73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cul7Q8VE73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cul7Q8VE73 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms