Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fyco1Q8VDC1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fyco1Q8VDC1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms