Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hip1Q8VD75 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hip1Q8VD75 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hip1Q8VD75 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hip1Q8VD75 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms