Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms