Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med17Q8VCD5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms